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大黄鱼育种国家重点实验室
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大黄鱼育种国家重点实验室正式发表染色体级别大黄鱼基因组图谱-龙8客户端下载

时间:2019-10-03 16:16 作者:admin 点击:次

       10月1日,在举国欢庆中华人民共和国70年华诞之际,大黄鱼育种国家重点实验室完成绘制的染色体级别大黄鱼高质量全基因组序列图谱,正式在nature集团旗下期刊《scientific data》发表。
 
       大黄鱼育种国家重点实验室与闽浙两省多家科研团队密切合作,依托国家海水鱼产业技术体系宁德综合试验站、大黄鱼国家级原种场、大黄鱼种质资源活体库等优势条件平台,自2016年全面启动“大黄鱼基因组选择育种计划”,旨在选育优质、高产、抗病抗逆的大黄鱼良种,全面提高大黄鱼养殖产业的良种化水平。为了给大黄鱼基因组选择育种提供高质量高精度的大黄鱼参考基因组序列图谱,研发更高质量的基因组育种工具,大黄鱼育种国家重点实验室和厦门大学海洋与地球学院紧密合作,利用第三代基因组测序技术和高通量染色体构象捕获测序技术,于2018年底完成了染色体级别的大黄鱼基因组序列图谱的绘制。该基因组图谱共包含24条染色体序列,覆盖了7.2亿碱基对,contig n50长度为283万碱基,新基因组中共包含23657个蛋白编码基因、7262个非编码rna及总长度约1.84亿碱基的重复元件。与近几年完成的数个大黄鱼基因组序列图谱相比,新版本基因组在序列一致性、完整性、准确性等方面均有了显著提高。
       大黄鱼产业的健康和可持续发展,离不开大黄鱼种质创新和优良养殖新品种培育。选育优质、高产、抗逆、抗病的大黄鱼养殖新品种,全面提升养殖大黄鱼产业的良种化比例,为大黄鱼养殖产业的健康和可持续发展提供种业保障,是大黄鱼养殖产业面临的重大需求。此次高精度大黄鱼基因组序列图谱的成功绘制,为在全基因组尺度上开展大黄鱼良种选育,加快大黄鱼种业创新工作步伐奠定了重要基础。
       为了提高新版本大黄鱼基因组序列图谱的利用效率,促进大黄鱼产业科技创新,营造开放共享和互惠共赢的创新创业氛围,充分发挥大黄鱼育种国家重点实验室的产业科技创新高地和技术攻关桥头堡的作用,大黄鱼国重室在2018年论文正式投稿前就向全社会开放共享新版大黄鱼基因组序列图谱和相关数据资源(下载链接为:),极大方便了国内外同行的相关科研和技术创新工作。
       该论文第一作者为厦门大学海洋与地球学院博士生陈葆华,通讯作者为国重室学术带头人徐鹏教授,富发水产有限公司技术人员柯巧珍等为共同作者。该研究获得了大黄鱼育种国家重点实验室自研经费和厦门大学校长基金等经费资助。论文链接:https://www.nature.com/articles/s41597-019-0194-3
 

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